Сам по себе Android поддерживает уйму форматов для флешек: fat, fat32, ext2, ext3. NTFS не поддерживает правда, что на самом деле не является минусом, потому, что НТФС как файловая система флеш-карты для смартфона - само по себе извращение.
Однако, на сколько мне известно при прошивке WildFire используя ClockworkMod Recovery, флешка в формате FAT32 является обязательным требованием.
Если смартфон видит флешку и в другом формате, то можете попробовать прошить, за одно и о практике такой отпишетесь ;)